HDDなど電源供給がギリギリだったりなどの状態になったりすると破損しやすいです。
マウス・キーボードなどはまだそれほど電気を使わないのでトラブルが少ないので表面化する事は少ないと思います。
その理由でハブ(電源供給できるアダプター付きなど)に限定されてきます。
内蔵用のHDDだろうと同様の症状にもなります。(HDDをいっぱい付けた状態での電源の容量ギリギリなのも危険です。)
電源供給が足りない状態で接続をしたりするとファイルエラー・文字化けなどの症状も起こりますし
HDD自体をフォーマットしますか?など表示される状態にもなります。酷い場合は故障もありえます。
基本は復元ソフトを使う事になります。解析などには時間も掛かりますし正常に戻るかも状態によります。
色々な復元ソフトが出ているので評判の良さそうなソフトを試してみるしかありません。
体験版などでは元々あったファイルの読み出しを出来るかまでの表示は出来るのでまずは体験版を試してみてください。
対策としては電源供給できないハブは使わない。出来ればPCと直接接続する。
ハブを使用しても問題ないのはマウスやキーボードやカードリーダーなど位と割り切った方が良いと思います。
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